Diagnostic accuracy of polymerase chain reaction for detection of mpox in humans

Abstract

[ABSTRACT]. Objective. To evaluate diagnostic accuracy of polymerase chain reaction (PCR) in detecting mpox infection in humans by pooling the estimates of sensitivity and specificity across different study settings. Methods. A systematic search was conducted in PubMed, Cochrane database, Scopus, and Google Scholar. Studies that evaluated the diagnostic accuracy of PCR test for the detection of monkeypox virus providing the sensitivity and specificity values and the total number of samples were included. The sensitivity and specificity values of PCR test were pooled for all the included studies. The meta-analysis was conducted in accordance with PRISMA guidelines using the metadta package in STATA software. A summary receiver operating characteristic (SROC) curve and forest plot were generated. The protocol was registered in PROSPERO (CRD-NIHR) database with Reference ID CRD42024590183. Results. Twelve studies were included for meta-analysis. The pooled sensitivity and specificity estimate across all the studies using a random effects model was 0.99 (95% CI [0.95, 1.00]) and 1 (95% CI [0.96, 1.00]), respectively. The SROC curve confirmed high diagnostic accuracy of PCR. The quality assessment of diagnostic accuracy studies (QUADAS) tool depicted low risk of bias. Conclusions. This systematic review and meta-analysis is the first study in the scientific literature to provide a pooling for diagnostic accuracy for PCR test for mpox and confirms it as an accurate tool in detecting the infection in humans.

[RESUMEN]. Objetivo. Evaluar la exactitud diagnóstica de la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) en la detección de la infección de mpox en el ser humano agrupando las estimaciones de sensibilidad y especificidad obtenidas en diferentes entornos de estudio. Métodos. Se realizó una búsqueda sistemática en PubMed, la base de datos Cochrane, Scopus y Google Scholar. Se incluyeron los estudios que evaluaron la exactitud diagnóstica de la prueba de PCR para la detección del virus de la mpox y proporcionaron los valores de sensibilidad y especificidad, así como el número total de muestras. Se agruparon los valores de sensibilidad y especificidad de la prueba de PCR de todos los estudios incluidos. El metanálisis se llevó a cabo siguiendo lo establecido en las directrices PRISMA, con el empleo del conjunto de metadatos, mediante el programa STATA. Se generó una curva de características operativas del receptor resumida (SROC) y un diagrama de bosque. El protocolo se registró en la base de datos PROSPERO (CRD-NIHR) con la identificación de referencia CRD42024590183. Resultados. Se incluyeron doce estudios en el metanálisis. La estimación agrupada de la sensibilidad y la especificidad en el conjunto de los estudios, con un modelo de efectos aleatorios, fue de 0,99 (IC del 95%: [0,95; 1,00]) y 1 (IC del 95%: [0,96; 1,00]), respectivamente. La curva SROC confirmó la gran exactitud diagnóstica de la PCR. La herramienta de evaluación de la calidad de los estudios de exactitud diagnóstica (QUADAS) mostró un riesgo bajo de sesgo. Conclusiones. Esta revisión sistemática y metanálisis es el primer estudio científico publicado que utiliza una agrupación de estudios para determinar la exactitud diagnóstica de la PCR en la mpox, y confirma que se trata de un análisis exacto para la detección de la infección en el ser humano.

[RESUMO]. Objetivo. Avaliar a acurácia diagnóstica da reação em cadeia da polimerase (PCR) para detectar a infecção pelo vírus da varíola símia (mpox) em humanos, combinando as estimativas de sensibilidade e de especificidade de estudos em diferentes contextos. Métodos. Foi realizada uma pesquisa sistemática das bases de dados PubMed, Cochrane, Scopus e Google Acadêmico. Foram incluídos na análise estudos que avaliaram a acurácia diagnóstica do teste de PCR para a detecção do vírus da varíola símia e que apresentavam os resultados de sensibilidade e especificidade e o número total de amostras. Os dados de sensibilidade e especificidade de todos os estudos incluídos na revisão foram combinados. A metanálise foi conduzida conforme as diretrizes PRISMA com o uso do pacote de metadados do software STATA. Os dados foram representados em uma curva característica de operação do receptor sumarizada (sROC) e um gráfico de floresta. O protocolo da revisão foi registrado na base PROSPERO (CRD-NIHR), sob o número de referência CRD42024590183. Resultados. Doze estudos foram incluídos na metanálise. As estimativas combinadas de sensibilidade e especificidade dos estudos com o uso de um modelo de efeitos aleatórios foram 0,99 (IC 95% [0,95, 1,00]) e 1 (IC 95% [0,96, 1,00]), respectivamente. A curva sROC confirmou a elevada acurácia diagnóstica do teste de PCR. A ferramenta de avaliação da qualidade dos estudos de acurácia diagnóstica (QUADAS) indicou baixo risco de viés. Conclusões. Esta revisão sistemática e metanálise é o primeiro estudo da literatura científica a combinar os resultados de acurácia diagnóstica do teste de PCR para varíola símia, confirmando que este é um instrumento preciso para detectar essa infecção em humanos.