Multidrug-resistant Salmonella spp. in fecal samples of pigs with suspected salmonellosis in Antioquia, Colombia, 2019–2021

Abstract

[ABSTRACT]. Objectives. To determine the proportion of Salmonella enterica in fecal samples of live pigs with suspected salmonellosis analyzed at the diagnostic unit of the University of Antioquia, Colombia between 2019 and 2021, and examine the serotypes and antimicrobial resistance patterns. Methods. This was a laboratory-based cross-sectional study of routine data on fecal samples received from pig farms in all nine subregions of Antioquia state, Colombia. Salmonella spp. detection at the university is done using enrichment, selective culture, and polymerase chain reaction. Serotypes were identified using the Kauffmann–White scheme and isolates were tested for antimicrobial susceptibility using broth microdilution. Results. Of 653 samples tested, 149 (23%) were positive for S. enterica. Nine serotypes were identified. The most common were Salmonella Typhimurium (56%) and its monophasic variant (35%). Resistance to ampicillin (70%) was most frequently observed, followed by ciprofloxacin (55%), and sulfamethoxazole–trimethoprim (52%). No isolates were resistant to amikacin and gentamicin. Multidrug resistance (resistance to ≥ 3 classes of antibiotics) was observed in 61 (44%) isolates. Multidrug resistance was highest in S. Typhimurium (57%) compared with the other serotypes. Serotype was associated with multidrug resistance (p = 0.01), but age of the pig and sub-region were not. Conclusions. The proportion of Salmonella spp. and the associated high levels of multidrug resistance are of concern and may indicate irrational use of antimicrobials and poor management practices in pig production systems in the region. Strengthened surveillance is needed to monitor and improve farm management prac- tices and the use of antimicrobials in farms in Colombia.

[RESUMEN]. Objetivos. Determinar la proporción de Salmonella enterica en muestras fecales de cerdos vivos con pre- sunta salmonelosis analizadas en la unidad de diagnóstico de la Universidad de Antioquia (Colombia) entre el 2019 y el 2021, así como examinar los serotipos y los patrones de resistencia a los antimicrobianos. Métodos. Se trata de un estudio transversal de laboratorio sobre datos ordinarios de muestras fecales pro- venientes de granjas porcinas de las nueve subregiones del departamento de Antioquia (Colombia). La detección de Salmonella spp. en la universidad se realiza mediante el enriquecimiento, el cultivo selectivo y la reacción en cadena de la polimerasa. Se identificaron los serotipos con el esquema de Kauffmann-White y se examinaron las cepas aisladas para determinar la susceptibilidad antimicrobiana mediante microdilución en caldo. Resultados. De las 653 muestras analizadas, 149 (23%) dieron un resultado positivo para S. enterica. Se iden- tificaron nueve serotipos. Los más comunes fueron Salmonella typhimurium (56%) y su variante monofásica (35%). La resistencia a la ampicilina fue la observada con mayor frecuencia (70%), seguida de la resisten- cia al ciprofloxacino (55%) y al sulfametoxazol-trimetoprima (52%). Ninguna cepa aislada fue resistente a la amikacina y la gentamicina. Se observó resistencia a múltiples fármacos (resistencia a tres o más clases de antibióticos) en 61 cepas (44%). La resistencia a múltiples fármacos fue más elevada en el caso de S. typh- imurium (57%) en comparación con los otros serotipos. Se asoció el serotipo con la resistencia a múltiples fármacos (p = 0,01), a diferencia de la edad del cerdo y la subregión. Conclusiones. La proporción de Salmonella spp. y los elevados niveles asociados de resistencia a múltiples fármacos son preocupantes y pueden ser un indicativo de uso irracional de antimicrobianos y malas prácticas de gestión en los sistemas de producción porcina de la región. Es necesario reforzar la vigilancia para dar seguimiento y mejorar las prácticas de gestión agropecuaria y el uso de antimicrobianos en las granjas en Colombia.

[RESUMO]. Objetivos. Determinar a proporção de Salmonella enterica em amostras de fezes de suínos vivos com sus- peita de salmonelose analisadas na unidade de diagnóstico da Universidade de Antioquia, Colômbia, entre 2019 e 2021, e examinar seus sorotipos e padrões de resistência a antimicrobianos. Métodos. Estudo transversal, de base laboratorial, utilizando dados de rotina de amostras de fezes recebidas de suinocultores em todas as nove sub-regiões do estado de Antioquia, Colômbia. A detecção de Salmonella spp. na Universidade é feita por enriquecimento, cultura seletiva e reação em cadeia da polimerase. Os sorotipos foram identificados usando o esquema de Kauffmann-White, e os isolados foram testados quanto à suscetibilidade aos antimicrobianos pelo método de microdiluição em caldo. Resultados. Das 653 amostras testadas, 149 (23%) foram positivas para S. enterica. Foram identificados nove sorotipos. Os mais comuns foram Salmonella Typhimurium (56%) e sua variante monofásica (35%). A resistência à ampicilina (70%) foi observada com maior frequência, seguida pela resistência ao ciprofloxa- cino (55%) e ao sulfametoxazol/trimetoprima (52%). Nenhum isolado apresentou resistência à amicacina ou gentamicina. Multirresistência (resistência a ≥ 3 classes de antibióticos) foi observada em 61 isolados (44%). A multirresistência foi mais comum em S. Typhimurium (57%), em comparação aos outros sorotipos. Foi con- statada associação da multirresistência com sorotipos (p = 0,01), mas não com idade do suíno ou sub-região. Conclusões. A proporção de Salmonella spp. e os níveis elevados associados de multirresistência a antimi- crobianos aqui constatados são preocupantes, e podem indicar uso irracional de antimicrobianos e práticas inadequadas de manejo nos sistemas de suinocultura da região. É preciso fortalecer a vigilância para moni- torar e melhorar as práticas de manejo agrícola e o uso de antimicrobianos em fazendas na Colômbia.