Modelos geoespaciales para control de brotes de SARS-CoV-2 en Cartagena y Barranquilla, Colombia, 2020

Abstract

[RESUMEN]. Objetivo. Determinar la estructura temporal y espacial del virus del síndrome respiratorio agudo grave (SARSCoV- 2, por su sigla en inglés), causante de la enfermedad por coronavirus (COVID-19, por su sigla en inglés) en las ciudades de Cartagena y Barranquilla para tomar acciones necesarias que apoyen el rastreo de contactos. Métodos. Estudio ecológico transversal que incluye análisis espacial basado en densidades Kernel de variables como casos, alertas desde una aplicación móvil, vulnerabilidad poblacional, índice de pobreza multidimensional, aplicación de interpolación espacial (IDW, por su sigla en inglés) de los casos activos y, por último, la aplicación de la técnica de superposición espacial como resultado final. Se utilizó la base de datos del Instituto Nacional de Salud de las ciudades de Cartagena y Barranquilla y el Departamento de Estadística Nacional. Resultados. El análisis determinó el comportamiento epidemiológico ascendente de los casos en las dos ciudades e identificó la dirección espacial de propagación de la enfermedad en los barrios, a través de la interpolación espacial. Se detectaron las zonas en las cuales intervenir en 15 barrios de Cartagena y 13 de Barranquilla, en 50 metros alrededor de los casos activos con menos de 21 días de evolución y según las capas de riesgo geográfico, como mecanismo para frenar la propagación de la COVID-19. Conclusiones. El análisis espacial permitió determinar la estructura temporal y espacial como metodología complementaria útil para el rastreo de contactos, y aportó la evidencia científica necesaria para la aplicación de medidas de intervención directa donde fuera necesario, dirigidas a reducir el contagio del SARS-CoV-2.

[ABSTRACT]. Objective. Determine the temporal and spatial structure of the severe acute respiratory syndrome virus (SARSCoV- 2) that causes coronavirus disease (COVID-19), in the cities of Cartagena and Barranquilla, Colombia, in order to take necessary actions to support contact tracing. Methods. Cross-sectional ecological study with spatial analysis based on kernel densities of variables, including cases, mobile application alerts, population vulnerability, multidimensional poverty index; inverse distance weighted spatial interpolation of active cases; and, finally, the spatial superposition technique as a final result. The database of the National Institute of Health of the cities of Cartagena and Barranquilla and the Department of National Statistics was used. Results. The analysis identified an upward epidemiological trend in cases in the two cities, and determined the spatial direction of disease spread in neighborhoods, through spatial interpolation. Intervention areas were detected in 15 neighborhoods in Cartagena and 13 in Barranquilla, 50 meters around active cases with fewer than 21 days of evolution and by geographical risk layers, as a mechanism to stop the spread of COVID-19. Conclusions. Spatial analysis proved to be a useful complementary methodology for contact tracing, by determining temporal and spatial structure and providing necessary scientific evidence for the application of direct intervention measures, where necessary, to reduce the spread of SARS-CoV-2.

[RESUMO]. Objetivo. Determinar a estrutura temporal e espacial do vírus da síndrome respiratória aguda grave (SARSCoV- 2, na sigla em inglês), causador da doença pelo coronavírus de 2019 (COVID-19, na sigla em inglês), nas cidades de Cartagena e Barranquilla, visando a tomar ações necessárias que apoiem o rastreamento de contatos. Métodos. Estudo ecológico transversal que inclui análise espacial baseada em densidade de Kernel de variáveis como casos, alertas de um aplicativo móvel, vulnerabilidade populacional, índice de pobreza multidimensional, aplicação de interpolação espacial (IDW, na sigla em inglês) de casos ativos e, por último, aplicação da técnica de sobreposição espacial como resultado final. Foram utilizadas as bases de dados do Instituto Nacional de Saúde para as cidades de Cartagena e Barranquilla e do Departamento Nacional de Estatística. Resultados. A análise determinou o comportamento epidemiológico ascendente dos casos nas duas cidades e identificou a direção espacial de propagação da doença nos bairros, por meio de interpolação espacial. Foram detectadas áreas para intervenção em 15 bairros de Cartagena e 13 de Barranquilla, em 50 metros ao redor dos casos ativos com menos de 21 dias de evolução e de acordo com as camadas de risco geográfico, como mecanismo para impedir a propagação da COVID-19. Conclusões. A análise espacial permitiu determinar a estrutura temporal e espacial como uma metodologia complementar útil para o rastreamento de contatos, e forneceu a evidência científica necessária para a aplicação de medidas de intervenção direta, quando necessário, visando a reduzir o contágio pelo SARS-CoV-2.