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Human respiratory syncytial virus and metapneumovirus in patients with acute respiratory infection in Colombia, 2000 - 2011

dc.contributor.authorBarbosa Ramirez, Julianaes_ES
dc.contributor.authorPulido Dominguez, Paolaes_ES
dc.contributor.authorRey Benito, Gloriaes_ES
dc.contributor.authorMendez Rico, Jairoes_ES
dc.contributor.authorCastellanos, Jaimees_ES
dc.contributor.authorPáez Martinez, Andréses_ES
dc.date.accessioned2015
dc.date.available2015
dc.date.issued2014es_ES
dc.identifier.citationBarbosa Ramirez, Juliana,Pulido Dominguez, Paola,Rey Benito, Gloria,Mendez Rico, Jairo,Castellanos, Jaime,Páez Martinez, Andrés (2014) Human respiratory syncytial virus and metapneumovirus in patients with acute respiratory infection in Colombia, 2000 - 2011. Rev Panam Salud Publica;36(2) 101-109,aug. 2014. Retrieved from http://www.scielosp.org/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1020-49892014000700005en_US
dc.identifier.urihttp://www.scielosp.org/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1020-49892014000700005es_ES
dc.identifier.urihttps://iris.paho.org/handle/10665.2/9980
dc.format.extentgrafes_ES
dc.format.extentmapases_ES
dc.format.extenttabes_ES
dc.relation.ispartofseriesRev Panam Salud Publica;36(2),ago. 2014es_ES
dc.subjectRespiratory syncytial viruseses_ES
dc.subjectMetapneumoviruses_ES
dc.subjectPolymerase Chain Reactiones_ES
dc.subjectRespiratory tract infectionses_ES
dc.subjectDiagnostic Techniqueses_ES
dc.subjectRespiratory systemes_ES
dc.subjectColombiaes_ES
dc.subjectVirus Sincitiales Respiratorioses_ES
dc.subjectMetapneumoviruses_ES
dc.subjectReacción en cadena de la polimerasaes_ES
dc.subjectInfecciones del Sistema Respiratorioes_ES
dc.subjectTécnicas de diagnóstico del sistema respiratorioes_ES
dc.subjectColombiaes_ES
dc.titleHuman respiratory syncytial virus and metapneumovirus in patients with acute respiratory infection in Colombia, 2000 - 2011en_US
dc.typeJournal articlesen_US
dc.rights.holderPan American Health Organizationen_US
dc.description.notesOBJECTIVE: To describe the epidemiology of respiratory syncytial virus (RSV) and human metapneumovirus (hMPV) in Colombia from 2000 - 2011, including seasonal trends. METHODS: Nasopharyngeal aspirates and/or throat swabs from 14 870 patients with acute respiratory infections (ARI) were studied. Two subgroups were analyzed using molecular biology techniques. The first consisted of 264 RSV indirect fluorescence assay (IFA)-positive samples, the second of 264 RSV IFA-negative samples. RSV and hMPV were detected using reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR). RESULTS: 2 799 samples (18.8%) contained a respiratory virus. RSV was detected by IFA in 1 333 samples (8.9%). RSV was detected by RT-PCR in 192 samples from the RSV IFA-positive subgroup and in 25 samples from the RSV IFA-negative subgroup. hMPV was detected in eight samples from the RSV IFA-positive subgroup and in 11 samples from the RSV IFA-negative subgroup. Among the RSV infections, subtype A was dominant in two-year intervals, subtype B was dominant in one-year intervals. 85.3% of RSV and 74% of hMPV infections occurred in children younger than 5 years old. RSV and hMPV infections were associated with rainy seasons. Co-infection with RSV A and RSV B was detected in two patients. Five cases of co-infection with RSV and hMPV were detected. CONCLUSIONS: This report is the first to examine the epidemiology of ARIs in Colombia, with an emphasis on RSV and hMPV. The samples studied here were obtained over a 12-year period and represent all age groups and both genders.(AU)en_US
dc.description.notesOBJETIVO: Describir la epidemiología y tendencias estacionales del virus sincitial respiratorio (VSR) y metapneumovirus humano (MPVh) en Colombia durante el período 2000 - 2011. MÉTODOS: Se recolectaron aspirados nasofaríngeos o hisopados faríngeos de 14 870 pacientes con infección respiratoria aguda. Se analizaron dos subgrupos por técnicas de biología molecular. El primero estuvo compuesto por 264 muestras positivas para el VSR por inmunofluorescencia indirecta (IFI), y el segundo estuvo compuesto por 264 muestras negativas para el VSR por IFI. La técnica utilizada para la detección del VSR y el MPVh en ambos subgrupos fue la transcripción inversa asociada a la reacción en cadena de la polimerasa (RT-PCR). RESULTADOS: 2 799 muestras (18,8%) contenían algún virus respiratorio. Se detectó VSR por IFI en 1 333 muestras (8,9%), e igualmente fue detectado por RT-PCR en 192 muestras en el subgrupo de muestras positivas para el VSR por IFI y en 25 muestras en el subgrupo de muestras negativas para el VSR por IFI. Se detectó MPVh en 8 muestras en el subgrupo de muestras positivas para el VSR por IFI, y en 11 muestras en el subgrupo de muestras negativas para el VSR por IFI. De las infecciones causadas por el VSR, el subtipo A fue dominante en períodos bianuales; en contraste, el subtipo B fue dominante en períodos anuales. El 85,3% de las infecciones por el VSR y 74% de las infecciones por el MPVh ocurrieron en niños menores de 5 años de edad. Las infecciones causadas por el VSR y el MPVh se asociaron con las estaciones de lluvia. Se encontró coinfección con VSR A y VSR B en 2 pacientes, y coinfección con VSR y MPVh en 5 pacientes. CONCLUSIONES: Esta investigación es la primera en estudiar la epidemiología de las infecciones respiratorias agudas en Colombia, con énfasis en las causadas por el VSR y el MPVh. Las muestras estudiadas fueron recolectadas durante un período de 12 años y representan todos los grupos etarios de ambos sexos.(AU)es_ES


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